Vakuolen sind farblose, blasenförmige Vertiefungen im Zytoplasma. Lymphozyten sind keine phagozytischen Zellen, daher sind Vakuolen bei ihnen weniger regelmäßig zu finden als bei Neutrophilen und Monozyten.

Wenn fast alle Lymphozyten Vakuolen aufweisen, liegt möglicherweise eine Stoffwechselstörung oder die Batten-Krankheit vor; beides ist jedoch recht selten. Manchmal sind Vakuolen in Lymphozyten ein Hinweis auf eine lymphoproliferative Erkrankung.